Член Американской Академии Косметической Стоматологии (AACD)
Член Европейской Ассоциации Эстетической Стоматологии (European Academy of Esthetic Dentistry).
Родился 17 июля 1966 году в Азербайджане, в городе Баку. В 1981 году окончил музыкальную школу по классу аккордеона с золотой медалью, а в 1988 - Первый Ленинградский медицинский институт.
С 1988 по 1989 работал в поликлинике №12 (Санкт-Петербург) врачом-стоматологом. В 1989 перешел в поликлинику №23, где десять лет проработал врачом-ортопедом. С 1999 занимал должность главного врача в стоматологической клинике "Астра", а с 2000 - в стоматологической клинике "Вероника".
В 2003 году создал «Клинику Доброго Стоматолога», где по настоящее время является генеральным директором.
Повышал квалификацию в Великобритании,Германии, Швеции, Италии, США, Испании, Израиле и Греции. В России в МАПО Санкт-Петербурга окончил курсы менеджмента. Автор 1 изобретения и 2 рацпредложений по методике нетрадиционного лечения тройничного нерва. Так же доктор Агаджанян получил 9 патентов на стоматологический программный комплекс "МастерКлиник".
Является первым российским врачом-стоматологом, ставший членом Европейской Ассоциации Эстетической Стоматологии. Действующий член Американской Ассоциации Косметической Стоматологии.
С 1999 года Э. Г. Агаджанян является членом общественного совета газеты "Стоматологический вестник" (Дантист), а с 2001 года - председателем Комиссии по информационной политике Стоматологической Ассоциации Санкт-Петербурга. В 2006 году Эмиль Гургенович занял должность вице-президента Ассоциации.
Эмиль Агаджанян - обладательмногих наград. Среди них медаль "Отличник стоматологии I степени", награды Стоматологической ассоциации России: "Золотой крокодил", "За вклад в дело популяризации специальности", "Лучший стоматологический сайт страны", за сайт газеты "Дантист. Стоматологический вестник", так же на счету Эмиля Агаджаняна более двадцати сетевых наград за профильные сайты в Интернете.
1999 году вышла книга «Записки доброго стоматолога», которая переиздавалась с тех пор шесть раз и обновляется по сей день.